Bohemia del sur desde hace mucho tiempo es reconocida sobre todo como una región agrícola, que a su vez, tiene una industria pesquera y forestal desarrollada. Sólo hasta el siglo pasado se llegó a desarrollar la industria dirigida a la elaboración en esta región. La región representa un conjunto bastante cerrado y su núcleo lo forma la cuenca de Moravia del sur. En el sudoeste está rodeada por Šumava, en el noroeste por el estribo de Brd, en el norte el altiplano de Bohemia central, en el este la meseta de Bohemia y Moravia y en el sudeste las montaňas de Novohradské. En la cuenca de Bohemia del sur se dividen a su vez dos valles, el de České Budějovice y el de Třeboň.
Una parte importante de los límites de la región están formados por la frontera con Austria y Alemania (con una longitud de 323 km), además limita con la región de Pilsen, la región de Bohemia central, la región de Vysocina y la región de Moravia del sur. El carácter fronterizo del sur de bohemia representa una posibilidad real para la colaboración en la esfera de la producción y en la esfera de los servicios, así como para el desarrollo del turismo para que los visitantes puedan aprovechar la belleza general de esta región que y disfrutar de la naturaleza y los monumentos culturales.
El área de la región es de 10 057 km2 , y representa el 12,8 % de toda la República Checa. De este área una tercera parte está formada por bosques y el 4 % está formado por ríos y lagos. La mayoría del territorio se encuentra a una altura sobre el nivel del mar de 400 - 600 m, debido a esto el clima local es bastante sevéro. El punto más alto del territorio de la región de Bohemia del sur es el pico de Šumava llamado Plechý (1378 m), por el contrario el punto más bajo (330 m) se encuentra en la presa Orlická en el distrito de Písek.
El área de la región pertenece a la cuenca del alto y medio Vltava con afluencia del Otava, Lužnice, Malše, Blanice y muchos otros. En el pasado se construyeron aquí más de 7000 estanques siendo hoy su superficie total de más de 30 mil hectáreas. Los mayores estanques son Rozemberk con un área de 490 hectáreas, Bezdrev con 450 y Horusický con 415 hectáreas que son a su vez los mayores estanques de la República Checa. Además de éstos, fueron construidas en la región grandes instalaciones como Lipno (con el mayor área acuática de la República Checa, 4870 ha), Orlík con amplias áreas de recreación y Římov, el cual abastece de agua potable a una importante parte de la región. Debido a la construcción de la central nuclear de Temelín se levantó la presa Hněvkovice.
Bohemia del sur no es una región rica en materias primas, no existen aquí casi ningunas fuentes de energía.Una riqueza natural importante de la región son los amplios bosques en la región de Šumava y en las montanas de Novohradské. Se trata, sobre todo, de bosques de árboles coníferos, abetos y de pinos. Las mayores fuentes de materias primas son los yacimientos de gravilla, de lodo para la fabricación de ladrillos, árido en polvo y arena de vidrio Otros recursos naturales son la turba y en algunas localidades también la caliza, la tierra infusoria y el grafito.
Se puede caracterizar el medio ambiente de la región, dentro del marco de la República Checa, como una región menos damnificada. Aunque existen aquí una serie de fuentes de contaminación, principalmente la agricultura y la industria. A pesar de las mejoras que han habido desde el año 1990 el curso del río Vltava se caracteriza, en su mayoría, como contaminado. Se puede apreciar una mejor situación en los ríos Otava y Lužnice. Se considera como más limpio el río Malše (sobre todo en los alrededores de la represa de Rimov) y la parte superior del río Vltava y Blanice. La vegetación de los bosques se conserva intacta en cuatro quintas partes y el resto es considerado como semidamnificado. Un fenómeno positivo es la pureza del aire, siendo uno de los más limpios de la República Checa.
La región siempre ha tenido más carácter recreativo que de zona de desarrollo industrial. El esfuerzo por conservar el medio ambiente se reflejó en la fundación del Parque Nacional de Šumava con un área de 685 685 km2 incluyendo una parte que pertenece a la región de Pilsen, lugares protegidos de la región de Šumava ( 945 km2 con una parte también en la región de Pilsen) , Třeboň (700 km2) y el bosque de Blanský (212 km2). En la Bohemia del sur también existen 288 secciones de pequenas áreas naturales protegidas y varias especies naturales protegidas.
Los centros de las ciudades České Budějovice, Český Krumlov (incluido entre los monumentos de la UNESCO), Jindřichův Hradec, Třeboň, Slavonice, Prachatice a Tábor son reservas históricas. Además de ellos hay en la región una serie de monumentos históricos como son, por ejemplo, el castillo de Hluboká nad Vltavou, en Český Krumlov, Blatná, Červená Lhota, los castillos de Zvíkov y Orlík. También es importante la arquitectura popular, sobre todo, el llamado "barroco lugareno". Entre los monumentos más representativos de este estilo se encuentra la plazoleta en Holašovice (distrito de České Budějovice), que fue incorporada en el año 1998 a los monumentos protegidos por la UNESCO.